Caracterización del genoma y análisis evolutivo de los virus de Gumboro circulantes en Uruguay

El virus de Gumboro (IBDV) es un patógeno que afecta gravemente a la industria avícola mundial, siendo uno de los principales causantes de millonarias pérdidas económicas a esa industria. La enfermedad de Gumboro (IBD) es de carácter inmunosupresora, afectando gravemente los parámetros productivos a través del aumento de la incidencia de otras enfermedades y la disminución de la tasa de conversión de los pollos. Su presentación puede ser desde una leve inmunodepresión subclínica hasta una grave inmunosupresión con altas tasas de mortalidad asociada. Esto depende de varios factores, pero principalmente de la cepa viral involucrada. Se conocen tres cepas de IBDV: clásicas, variantes e hipervirulentas. Las dos primeras se presentan generalmente en forma subclínica, y debido a esto se las llama también cepas de baja patogenia. Por el contrario, las cepas hipervirulentas son las más agresivas, con cuadros clínicos característicos, y por eso se las conoce como cepas de alta patogenia. El criterio de clasificación más aceptado actualmente se basa en la caracterización genética. Típicamente, se amplifica un fragmento correspondiente a la región hipervariable de la proteína de cápside VP2 (principal determinante antigénico), se secuencia y finalmente se realizan análisis filogenéticos y de marcadores aminoacídicos. Nuestro grupo de trabajo ha realizado este tipo de análisis en muestras de campo uruguayas desde el año 2004. Llamativamente, desde el año 2007 todas los virus de campo analizados tienen características genéticas particulares, diferentes a las encontradas en los virus de las tres cepas existentes. A través de análisis filogenéticos, estos virus se agrupan claramente en un linaje diferente, por fuera de los linajes correspondientes a los virus clásicos, variantes e hipervirulentos. Sumado a esto, el análisis aminoacídico muestra que este grupo viral tiene marcadores únicos altamente conservados, que además se encuentran en regiones de la proteína que son conocidas por causar cambios antigénicos. Buscando información de este tipo de virus a nivel mundial, si bien existen reportes aislados donde encuentran algunos virus con estas características, nunca se ha propuesto que se trata de un linaje diferente, y por lo tanto no se han estudiado a fondo sus características genéticas, antigénicas o patogénicas. En el presente proyecto se propone realizar por primera vez la secuenciación completa de estos virus. Luego de secuenciar el genoma codificante y compararlo con las secuencias disponibles en la base de datos, se realizarán análisis bioinformáticos con el fin de estimar distintos parámetros evolutivos que permitan conocer más a fondo el comportamiento de este grupo viral. Este proyecto pretende demostrar la existencia de un linaje de IBDV diferente, y analizar su origen y evolución.