Caracterización de ARNm asociados a mitocondria en Trypanosoma cruzi.

Trypanosoma cruzi es el protozoo parásito causante de la enfermedad de Chagas que afecta actualmente a 21 paises de América latina. Este parásito posee un ciclo de vida complejo que alterna entre dos huéspedes.Entre las características excepcionales de T. cruzi se destaca la presencia de una única gran mitocondria que contiene hasta el 25% del ADN celular total y que se extiende a lo largo del cuerpo celular del parásito. En la matriz mitocondrial, se encuentra un complejo entramado de fibras de ADN que forma una estructura conocida como kinetoplasto. Se mostró para T. brucei, así como para T.cruzi que existe un alto número de proteínas mitocondriales que no se encuentran codificadas en el kinetoplasto. Estas proteínas son codificadas a nivel nuclear y dirigidas a la mitocondria principalmente a través de señales en la secuencia peptídica. El hecho de que existan proteínas mitocondriales que no posean péptido señal plantea un reto mayor a la hora de la búsqueda in silico de las mismas. Se ha descripto para S. cerevisiae la función de la proteína Puf3 que se asocia con un subgrupo de 154 ARNm que casi exclusivamente codifican para proteínas mitocondriales, muchos de los cuales están involucrados en la síntesis de proteínas. Este antecedente, que también ha sido descrito en humanos, apoya la idea de que los ARNm que codifican para proteínas de organelos subcelulares podrían estar reguladas en espacio y tiempo por proteínas específicas de unión al ARN. Aunque, estudios realizados tanto en T. cruzi como en T. brucei, determinaron que ciertos ARNm funcionalmente relacionados se regulan de forma coordinada apoyando la existencia de operones postranscripcionales en estos organismos, aun no se han encontrado factores que cumplan una función semejante a la asociada con Puf3. Por otra parte se han caracterizado numerosos elementos en cis, tanto a nivel de secuencia como de estructura, que son blanco de proteínas reguladoras de unión específica. La mayor parte de estos elementos regulatorios se localizan en la región 3’ no traducida de los mismos (3’ UTR)Sin embargo, hasta la fecha no se han descripto señales de localización subcelular para los mensajeros de origen nuclear que codifican para proteínas mitocondriales carentes de péptido señal. Este trabajo pretende profundizar en la comprensión de los procesos que permiten localización subcelular de mensajeros específicos. Particularmente, nos proponemos estudiar los transcriptos nucleares que se localizan en el entorno mitocondrial en Trypanosoma cruzi, mediante una aproximación in silico con confirmación experimental.